교육신청

  • Bio-Express 활용교육
  • Python과 Tensorflow를 이용한 Deep learning

유전체 정보 분석을 위한 Bio-Express 활용교육

  • 교육 일시 : 2018년 6월 29일
  • 교육 장소 : 한국생명공학연구원 나눔관 대회의실
  • 교육 목적 : 대용량 유전체 분석을 위한 클라우드 서비스(Bio-Express) 활용교육
  • 교육 대상 : 생명(연) 소속 연구자 / 20명 (선착순)
  • 신청 기간 : 2018-06-14 ~ 2018-06-22
  • 강의 개요 : 국가생명연구자원정보센터에서는 국내 연구자들을 대상으로 현장 중심형 생명정보 전문 인력 양성 및 실무에 필요한 분석 기술을 전파하고자 교육을 운영하고 있습니다. 다양한 NGS 분야의 분석 파이프라인을 탑재한 클라우드 기반의 고속 분석 서비스인 Bio-Express를 이용하여 입문자도 실제 대용량 데이터 분석에 쉽게 활용할 수 있는 분석 교육을 실시합니다.
교육신청
시 간 주 제
10:00 ~ 11:00 국내 클라우드 기반의 무료 분석 플랫폼 Bio-Express 소개
11:00 ~ 12:00 고속 대용량 데이터 전송 시스템 소개 (데모) 및 시연
실습 : KOBIC 대용량 데이터 전송 소프트웨어를 이용한 데이터 전송

워크플로우 기반 분석 서비스 CLOSHA 소개 (데모) 및 시연
실습 : 웹 기반의 대용량 유전체 데이터 분석 플랫폼의 상세한 활용법
12:00 ~ 13:30 중 식
13:30 ~ 15:00 Bio-Express 플랫폼을 활용한 NGS 데이터 기본 분석 기법 실습
- NGS Read quality control(QC) 분석
- Alignment/Mapping 분석 (BWA, Bowtie2)
- SAMtools 분석 도구 활용하기
- GATK 분석 도구를 활용한 Realignment 분석
15:00 ~ 15:15 휴 식
15:15 ~ 16:30 Bio-Express 플랫폼을 활용한 RNA-seq 데이터 기본 분석 기법 실습
- RNA-seq Short Reads quality control (QC) 분석
- STAR 프로그램을 이용한 Alignment/Mapping 분석
- RSEM 프로그램을 이용한 Quantification 분석

Bio-Express 플랫폼 등록 분석 파이프라인을 이용한 분석 실습

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